書敍由蓮花轉世的白蓮岸,路遇白猿仙翁,授天書一卷,遂擅天文地理、陰陽變幻以及戰陣用兵之術,又得到強盜藏金,遂創白蓮教,以柳林為屯兵之所,稱雄天下。白蓮岸思效武則天愛六郎故事,乃女扮男裝,離柳林,企圖尋覓中意郎君。路遇書生王昌年,一見傾心。昌年已有未婚妻香雪,不為白蓮岸所動。白蓮岸思得昌年,乃資助其上京考試,自己又往昌年家鄉河南府,欲交好香雪。至河南,聞香雪繼母逼迫香雪嫁富室為妾,遂裝富公子,入贅香雪家,告以原委。昌年回鄉,聞香雪已嫁,恨恨而去,至京考試連捷,授官刑部。巧逢白蓮岸、香雪為人所誣入獄,押刑部勘問,昌年為其平反,真相大白。白蓮岸回柳林,而昌年因白蓮岸事牽連下獄。白蓮岸為救昌年,率部投降,朝廷令將白蓮岸斬首。臨刑時,白蓮岸用術遁去。後昌年與香雪夫妻團聚,白蓮岸頓悟前身,皈依佛門。
白蓮教起義自元末紅巾軍劉福通、韓山童起,絡繹不絕,明永樂年間唐賽兒起義,最為哄傳,清呂熊之《女仙外史》即述其事。書寫唐賽兒得法書,遂精法術,聚眾起義,最終被捕,以法術自脱。《歸蓮夢》所寫白蓮岸,與唐賽兒相彷彿,前世均有來歷,均以女兒身通法術,率兵與朝廷抗爭,結局也如出一轍。但與唐賽兒不同的是,白蓮岸的一生充滿對愛情的執着追求,乃至不惜放棄事業與生命,比神化了的唐賽兒多了人情味,人物形象也更為真實、豐滿。《歸蓮夢》與《女仙外史》比,也僅以白蓮教起義作為人物活動的背景,不同於《女仙外史》時時以史為綱;因此,《歸蓮夢》是神魔與人情結合得比較好的小説。