全書三十二回,根據情節發展可分三大部分:第一部分孫家遭難,包括大理寓居定遠到被害身亡等情節;第二部分皮五發跡,自孝姑出嫁引出皮五,這一部分着重敍寫皮五發跡變態的歷史,是全書的主幹;第三部分包公昭雪,與第一部分相呼應,並補充交待了文理的遭遇,孫家血冤得以昭雪。作品中的包公只是一個類型化人物,作者假以結撰故事,宣揚警世,而重點刻畫的是強氏和皮五兩個形象。
該書借公案故事為框架,宣揚了因果報應思想,勸喻世人棄惡從善;而且通過皮五發跡,反映了市井平民希求改變自身窮困低賤的社會地位的普遍心理和美好願望。
《清風閘》結構方面有個獨特之處,就是依託公案故事框架。這個公案的梗概是:孫大理年老喪妻又續娶。年輕妻子強氏淫蕩、與孫大理的義子通姦。二人害死孫大理,在清風閘偽造孫大理跳水自殺假象。強氏又坑害孫大理前妻的女兒,堅持把她嫁給最貧窮潦倒的無賴漢。媒婆因此想到皮五。此女在皮五家苦熬歲月,終於時來運轉,向包公申冤成功。這個公案梗概與《警世通言》中《三現身包龍圖斷案》相近。
從小説發展史的角度來看,《清風閘》繼承了以前公案小説的傳統,尤其受到包公案的啓發,但在藝術上,此書已與傳統公案小説有所不同,作者對包公斷案的描寫相對減弱,而對相關故事的描寫則有了很大的加強,尤其對故事中幾個主角的刻畫都比較生動,情節發展的內在邏輯也比較可信。作品用生動的語言描寫南方下層社會生活,人物形象亦鮮明活潑,其中人情冷暖,頗有可觀之處,是一部獨具特色的小説。