現存的《高士傳》分上、中、下三卷,採堯、舜、夏、商、周、秦、漢、魏古今八代之士,立91傳,其中《長沮桀溺》、《魯二徵士》一傳記2人,《四皓》一傳記4人,共記96人。
在42歲至46歲時,他患風痹,肢體不遂,因而潛心鑽研醫學;手不釋卷。魏晉朝廷曾幾次請他出仕,他堅辭不就,一心致力醫學,尤以針灸方面取得的成就最大。他汲取了《素問》、《靈樞》、《明堂孔穴針灸治要》三書有關針灸的重要內容,總結了秦漢三國以來的針灸成就,融合了自己的臨證經驗,於公元256-282年,寫成了《黃帝三部針灸甲乙經》,簡稱《針灸甲乙經》或《甲乙經》,是我國現存的最早針灸專著。全書12卷,128篇。書中敍述了人體生理、病理,重點介紹了腧穴,詳細論述了針灸操作方法,並把各種適應證按照臨證需要排列出來。由於他在編纂過程中是“刪其浮辭,除其重複,論其精要”,故很切實用,易於掌握。該書影響久遠,其它的著名針灸著作,都是在《甲乙經》的基礎上發揮發展而成。該書早已流傳國外,並被翻譯成多國文字,在世界上有深遠的影響。
立傳的標準,用皇甫謐自己的話説是“身不屈於王公,名不耗於終始”(《皇甫謐·高士傳序》)。按照這個標準,被孔子、司馬遷稱頌過的伯夷、叔齊,被班固表彰過的“兩龔”即龔勝、龔舍,也不在立傳之列。伯夷、叔齊寧肯餓死,恥食周粟,執節很高,但畢竟有過“叩馬而諫”的自屈行為;兩龔斷然拒絕出仕新莽,晚節很好,但早年總是出過仕的。因此,皇甫謐《高士傳》記載的96名高士全是經過旁推毖緯、鈎探九流、水中澄金而得到的沒有出過仕的“高讓之士”(《高士傳序》)。比較真實的反映了當時的社會面貌及一部分知識分子的社會生活,甚至於一個側面的社會歷史。
目錄:
法會因由分 第一
善現啟請分 第二
大乘正宗分 第三
妙行無住分 第四
如理實見分 第五
正信希有分 第六
無得無說分 第七
依法出生分 第八
一相無相分 第九
莊嚴淨土分 第十
無為福勝分 第十一
尊重正教分 第十二
如法受持分 第十三
離相寂滅分 第十四
持經功德分 第十五
能淨業障分 第十六
究竟無我分 第十七
一體同觀分 第十八
法界通化分 第十九
離色離相分 第二十
非說所說分 第二十一
無法可得分 第二十二
淨心行善分 第二十三
福智無比分 第二十四
化無所化分 第二十五
法身非相分 第二十六
無斷無滅分 第二十七
不受不貪分 第二十八
威儀寂靜分 第二十九
一合理相分 第三十
知見不生分 第三十一
應化非真分 第三十二